Les méthodes utilisées pour l'extraction et la purification du produit relèvent de la chimie :

• Concentration du  milieu de culture par précipitation, évaporation, filtration sur membrane, adsorption,...
• Purification par cristallisation, méthodes chromatographiques.

Les coûts d'extraction et de purification sont souvent très élevés :

• 30% pour la pénicilline
• Plus de 50% pour certaines protéines humaines.

Le biologiste doit donc, non seulement optimiser la production mais il doit aussi penser à faciliter l'exrtraction et la purification du produit

Les procédé de séparation des cellules du milieu de culture